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测序技术联手捕获肝癌免疫状态

2019-11-02 04:30 来源:  中国健康网
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  (记者王潇雨)10月31日,《细胞》杂志刊发由北京大学生物医学前沿创新中心、北京未来基因诊断高精尖创新中心张泽民课题组联合首都医科大学附属北京世纪坛医院彭吉润课题组等完成的研究成果,首次对肝癌临床样本进行包括病理组织在内的多组织位点的收集,并利用前沿的生物信息学分析方法,通过自体对照,描述了肝癌微环境的免疫组分和状态,以及肿瘤浸润免疫细胞跨组织的动态过程。
 
  “中国的肝癌发病率居世界之首,乙肝病毒的慢性感染则是导致肝癌发生发展的主要原因。”张泽民介绍,“现有研究表明,肝癌存在多种免疫逃逸机制,并与其所处的肿瘤微环境关系密切。研究肝炎病毒感染导致的慢性炎症性肿瘤微环境中不同免疫细胞的状态,具有重要意义。”
 
  该研究招募了16名肝细胞癌初治患者,这些患者术前未经任何放化疗等辅助治疗。研究人员通过手术获取了癌组织等,收集到这些组织中的CD45+免疫细胞,并整合了10xGenomics和全长单细胞RNA测序技术,对这些免疫细胞进行了单细胞测序。
 
  研究人员发现了一群高表达LAMP3的新型树突状细胞,这群细胞可以从肿瘤迁移到肝周淋巴结,并表达多种免疫配体基因,具有与多种T淋巴细胞类型相互作用的潜力。研究同时发现,肿瘤中的巨噬细胞亚群表现出不同的转录状态和向腹水转移的能力。
 
  “腹水中含有大量髓系细胞,其产生与肝癌预后不良有关,但具体联系尚未完全明确。我们发现,腹水中的髓系细胞和淋巴细胞分别主要来源于肿瘤和血液,但肿瘤来源的有增殖活性的T细胞往往倾向于在腹水中累积。”彭吉润说,该结果为利用肝癌患者的腹水代替活检组织进行肿瘤免疫状态的监测提供了可能性依据,但仍需进一步探索。
 
  此外,张泽民介绍,不同的测序技术在细胞捕获和基因捕获上具有不同的优势。结果发现,联合使用10xGenomics和全长单细胞RNA测序技术进研究,或可成为相关研究策略之一。